En contraposición con las denominadas aguas blancas, las negras suelen ser de ácidas a muy ácidas, con registros de pH que pueden ser inferiores a 4,5 y con durezas en algunos casos casi inapreciables, al ser aguas con un bajo contenido en minerales.
Las tierras que rodean estas aguas son pobres, razón por la cual están más deshabitadas que las tierras atravesadas por cursos de aguas blancas. Son aguas con cantidades ínfimas de nutrientes y cuya visibilidad apenas supera los dos metros.

También se llaman aguas negras a las procedentes de los vertidos de la actividad humana. Se caracterizan por ofrecer volúmenes menores, caudales más contínuos y contaminación mucho mayor que la de las aguas blancas.

Aguas que se encuentran en su mayoría, en cauces de América Central y en menor medida en el África Tropical. Se caracterizan por ser aguas blandas, ácidas y ricas en material orgánico. Poseen un color negruzco por la cantidad de materia orgánica que lleva.