Moléculas de estructura lineal formadas por una cadena de aminoácidos (entre 10 y 50) unidos entre si por enlace peptídico. Cadenas mayores de 50 aminoácidos pasan a considerarse proteínas. Una proteína puede estar formada por uno o varios polipéptidos. Algunos polipéptidos tienen funciones estructurales, otros funciones hormonales y otros polipéptidos tienen funciones enzimáticas. Ejemplo: En el veneno proteolítico de algunas serpientes existen polipéptidos que pueden actuar como neurotoxinas, cardiotoxinas y miotoxinas que producen parálisis respiratoria y depresión cardiovascular.